ホームページから代表者等変更フォームを使って変更することができます。
また、自治会・管理組合変更届兼連絡票のダウンロードもできますので、下記の参考URLを参照してください。

代表者等変更フォーム、自治会・管理組合変更届兼連絡票で変更いただいた内容は、神戸市から貴団体への行政上の連絡や広報印刷物の送付のために企画調整局広報戦略部、地域協働局地域活性課、区役所地域協働課、環境局業務課で共有します。
※上記以外の部署が実施している補助事業や助成事業、イベント等の関係で代表者の変更を届ける必要がある場合は、個別に担当課に変更の連絡をしていただくようお願いします。

なお、認可地縁団体の代表者変更は別途手続きが必要となりますので、下記の参考URLをご覧いただくか、地域協働局地域活性課までお問い合わせください。

【参考URL】
神戸市ホームページ：自治会・管理組合の代表者等変更届のページ