国税である所得税と、地方税である市県民税（住民税）は異なる税金です。
いずれも、1月1日から12月31日までの１年間に得た所得に対して課税されますが、市県民税が所得のあった年の翌年度に課税されるのに対して、所得税は現年（所得のあった年）に課税されます。
課税対象となる「年」が異なるという点以外にも、税率や控除額の計算方法等においても違いがあります。
詳しくは、「住民税（市県民税）と所得税の違い」をご覧ください。
なお、所得税の確定申告を行っていれば、税務署から神戸市に情報が共有されるため、市県民税の申告を行う必要はありません。